所謂的殘念生物，就是指雖然努力，但在某方面有點缺陷的生物。《電影版殘念生物事典》從日本暢銷突破450萬冊的超人氣童書《殘念生物事典》中，選出三篇經典故事，透過澳大利亞的無尾熊、南極企鵝與日本長野縣的日本兔，三個地區的三種不同生物告訴觀眾：「就算殘念也沒關係」，每一種生物都有其存在意義，不只能讓小朋友看得開心，大人們也可以看得超有感的溫暖故事！
《電影版殘念生物事典》由《角落小夥伴電影版》、《衝吧烈子》動畫公司「Fanworks」精心打造，將教科書學不到的冷門生物知識，透過有些可惜、有些小缺點的「殘念」角度呈現，不僅不會讓人失望，反而更加貼近大眾與動物的距離，加深對生物知識的親近感。並在描述生物知識之餘，也賦予許多成長與生存的意義在電影當中，保證讓大人們看了超級有感！舉例來說，澳大利亞篇以無尾熊「勒羅伊」離開媽媽，踏上尋找屬於自己的「家園樹」為主軸，對離開舒適圈而碰到的一連串冒險與威脅，都是為生存而努力的象徵，向觀眾們闡述不用勉強自己，只要活下來就已經是超棒的事情！
導演內山勇士自導自編的南極篇則不走溫馨路線，而是加入大量日式「漫才」元素，看三隻企鵝一邊吐槽，一邊幫助皇帝企鵝找到回家的路，還用Instagram發美照變網紅，笑料百出的安排，讓其他篇的導演大讚：「第一個鏡頭就像是突然出拳般讓人印象超深刻！」
日本篇則以親子關係為核心，導演也在製作時，想像跟家人一起觀賞的感覺，並透過森林裡的不同物種，畫出每個家庭對成長看法的差異。尤其本篇特別在生物習性上增添成長意義，希望觀眾在觀賞時，可以多加注意主角「兔雄」在故事裡前後的差別。
《電影版殘念生物事典》雖然大量出現殘念元素，但全片核心始終都在告訴觀眾：「就算殘念也沒關係」，每一種生物都有其存在意義，而擔任該系列監修的今泉忠明則表示：「有很多有點殘念的生物，會讓你無意間笑出聲。不進化也沒關係，有點怪異也沒關係，每個生物都正努力存活著。」
有趣的是，不只電影中的動物們很殘念，劇組也自爆「人類」有更多不遑多讓的殘念點，讓導演們深有所感地將自己熬夜、忘記時間、看不懂字跡等殘念祕密大公開！澳大利亞篇的導演奈奧米岩田就表示：「我常在半夜要睡覺時靈光乍現，趕快把想法寫下來再去睡覺，但隔天起床後，卻一個字都看不懂。」爆料自己在創作靈感上也是相當殘念。負責日本篇的由水桂導演則分享，他觀察到人所說出的話，會和記憶裡有所落差，特別是「日期」的部分，他透露：「大家說出『原來是今天』的次數，遠比想像中還要多喔。」而南極篇導演內山勇士，更對熬夜的殘念之處有感而發：「我每次都忍不住熬夜，雖然常常會想『為了健康著想，我不可以繼續熬夜！』而盡可能培養早起習慣，而且起床時感受到陽光，都讓我不禁感覺真美好，只是一個禮拜過去，我又被打回原狀了！」他接著自爆：「我甚至不是工作到天亮，而是看YouTube一整晚呢！」
有別於過去多會採用正面形象來描繪生物，本片則反向操作，透過有些可惜、有些小缺點的「殘念」角度呈現，不僅不會讓人失望，反而更加貼近大眾與動物的距離，加深對生物知識的親近感。
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